1992年，日政府在关西的筑波建立国际哥斯拉对策中心世界科技精英共聚一堂，合力研究一部G超武器—机械哥斯拉。以大前博士为首的考察团到达亚度诺亚岛时，发现了一只完整无缺的蛋。当团员把蛋带回京都时飞翼龙拿顿出现并攻击考察团一行人。这时哥斯拉亦在亚度诺亚岛出现，两只怪兽由海上战斗到陆上……...

1992年，日政府在关西的筑波建立国际哥斯拉对策中心。世界科技精英共聚一堂，合力研究一部G超武器—机械哥斯拉。以大前博士为首的考察团到达亚度诺亚岛时，发现了一只完整无缺的蛋。当团员把蛋带回京都时飞翼龙拿顿出现并攻击考察团一行人。这时哥斯拉亦在亚度诺亚岛出现，两只怪兽由海上战斗到陆上……...

世界知名画家松下庆山在自己的画室身亡，现场尸体被烧焦难辨，价值数十亿的画作也随大火付诸一炬。是自杀？他杀？风祭（椎名桔平饰）警部和其助手丽子（北川景子饰）虽仔细勘查，多方取证，也未能挖掘出真相。 　　回家后，丽子习惯性地向管家影山（樱井翔饰）讲述案件的经过，出人意料的是，丽子心中的推理天才这次竟然表示无能为力。 　　丽子失望地讲述起自己在旅游时遇到的另一段奇怪经历，而影山的反应和其他人一样，也...

债台高筑的普通上班族古叶完治（椎名桔平饰）恼羞成怒，杀害了黑帮组织御殿川组的组长（高岛政宏饰）。在此之后，他改姓北原，只身逃往南美躲藏，并在当地一家赌场谋得职业。十年后的一天，赌场老板命令他回日本刺杀暴虐蛮横的实业家狭土万正（山路和弘饰）。为避免遭到国际通缉，北原只得硬着头皮重返故土。此时此刻，日本正因大地震和核泄漏饱受恐慌的折磨。御殿川组如今在控制在三姐妹亚芽（木村绿子饰）、仁子（赤间麻里子饰）...